Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZRN4Q6ZMN7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDZRN4Q6ZMN7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZRN4Q6ZMN7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms