Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYHR1Q6ZMK1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYHR1Q6ZMK1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYHR1Q6ZMK1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms