Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPTNQ6XPR3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPTNQ6XPR3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPTNQ6XPR3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPTNQ6XPR3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms