Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG3Q6UXM1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG3Q6UXM1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG3Q6UXM1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms