Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VSTM1Q6UX27 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VSTM1Q6UX27 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VSTM1Q6UX27 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM1Q6UX27 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms