Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SFTA2Q6UW10 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFTA2Q6UW10 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA2Q6UW10 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms