Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYCE2Q6PIF2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYCE2Q6PIF2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCE2Q6PIF2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCE2Q6PIF2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms