Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CTR9Q6PD62 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTR9Q6PD62 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTR9Q6PD62 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTR9Q6PD62 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms