Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC4Q6P4E1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC4Q6P4E1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC4Q6P4E1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1276.2 ms