Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFXN4Q6P4A7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFXN4Q6P4A7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms