Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Q6P435 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6P435 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6P435 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6P435 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6P435 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6P435 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q6P435 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6P435 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6P435 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6P435 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6P435 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6P435 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6P435 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6P435 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6P435 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6P435 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6P435 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q6P435 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q6P435 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q6P435 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q6P435 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q6P435 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q6P435 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q6P435 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q6P435 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q6P435 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q6P435 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6P435 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6P435 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6P435 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6P435 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6P435 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6P435 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6P435 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6P435 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q6P435 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6P435 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6P435 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6P435 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6P435 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q6P435 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6P435 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6P435 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6P435 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6P435 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6P435 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q6P435 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6P435 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6P435 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6P435 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q6P435 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6P435 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6P435 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6P435 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6P435 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q6P435 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6P435 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6P435 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6P435 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6P435 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q6P435 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6P435 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6P435 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6P435 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6P435 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6P435 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6P435 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6P435 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6P435 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6P435 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6P435 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6P435 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6P435 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6P435 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6P435 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6P435 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6P435 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6P435 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6P435 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6P435 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6P435 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6P435 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6P435 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6P435 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6P435 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6P435 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6P435 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6P435 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6P435 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6P435 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6P435 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6P435 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6P435 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6P435 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6P435 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6P435 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6P435 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6P435 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6P435 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms