Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LARP1BQ659C4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1BQ659C4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LARP1BQ659C4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LARP1BQ659C4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms