Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EEF1DP3Q658K8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
EEF1DP3Q658K8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EEF1DP3Q658K8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms