Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RNF123Q5XPI4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
RNF123Q5XPI4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
RNF123Q5XPI4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RNF123Q5XPI4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms