Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM236Q5W0B7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM236Q5W0B7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM236Q5W0B7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM236Q5W0B7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160 ms