Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYDE2Q5VT97 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYDE2Q5VT97 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYDE2Q5VT97 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms