Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM164Q5U3C3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM164Q5U3C3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM164Q5U3C3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms