Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIN9Q5TKA1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LIN9Q5TKA1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LIN9Q5TKA1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIN9Q5TKA1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms