Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHYHD1Q5SRE7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHYHD1Q5SRE7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHYHD1Q5SRE7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHYHD1Q5SRE7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms