Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNT1Q5JUK3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNT1Q5JUK3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNT1Q5JUK3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNT1Q5JUK3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms