Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGD3Q5JSP0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD3Q5JSP0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms