Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTBL2Q562R1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTBL2Q562R1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTBL2Q562R1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTBL2Q562R1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTBL2Q562R1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTBL2Q562R1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTBL2Q562R1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTBL2Q562R1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms