Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL22Q53GT1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL22Q53GT1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL22Q53GT1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms