Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL12Q53G59 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL12Q53G59 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms