Protein–RNA interactions for Protein: Q49A17

GALNTL6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNTL6Q49A17 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNTL6Q49A17 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GALNTL6Q49A17 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNTL6Q49A17 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms