Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q499Y3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q499Y3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q499Y3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q499Y3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q499Y3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q499Y3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q499Y3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q499Y3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q499Y3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q499Y3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q499Y3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q499Y3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q499Y3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q499Y3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q499Y3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q499Y3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q499Y3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q499Y3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q499Y3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q499Y3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q499Y3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q499Y3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q499Y3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q499Y3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q499Y3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q499Y3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q499Y3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q499Y3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q499Y3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q499Y3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q499Y3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q499Y3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q499Y3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q499Y3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q499Y3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q499Y3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q499Y3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q499Y3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Q499Y3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q499Y3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q499Y3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q499Y3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q499Y3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q499Y3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q499Y3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q499Y3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q499Y3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Q499Y3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q499Y3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q499Y3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q499Y3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q499Y3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q499Y3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q499Y3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q499Y3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q499Y3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q499Y3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q499Y3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q499Y3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q499Y3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q499Y3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q499Y3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q499Y3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q499Y3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q499Y3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q499Y3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q499Y3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q499Y3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q499Y3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q499Y3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q499Y3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q499Y3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q499Y3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q499Y3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q499Y3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q499Y3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q499Y3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q499Y3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q499Y3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q499Y3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q499Y3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q499Y3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q499Y3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q499Y3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q499Y3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q499Y3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q499Y3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q499Y3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q499Y3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q499Y3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q499Y3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q499Y3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q499Y3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q499Y3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q499Y3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q499Y3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q499Y3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q499Y3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q499Y3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms