Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LONRF3Q496Y0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LONRF3Q496Y0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LONRF3Q496Y0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms