Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT71Q3SY84 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT71Q3SY84 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT71Q3SY84 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms