Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SP6Q3SY56 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SP6Q3SY56 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms