Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNGA3Q16281 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGA3Q16281 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGA3Q16281 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA3Q16281 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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