Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6AP1Q15904 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6AP1Q15904 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP6AP1Q15904 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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