Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERC1Q15751 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HERC1Q15751 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERC1Q15751 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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