Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIP11Q15643 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIP11Q15643 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIP11Q15643 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIP11Q15643 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIP11Q15643 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIP11Q15643 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIP11Q15643 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIP11Q15643 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIP11Q15643 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIP11Q15643 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIP11Q15643 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIP11Q15643 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIP11Q15643 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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