Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC23BQ15437 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC23BQ15437 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC23BQ15437 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23BQ15437 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23BQ15437 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23BQ15437 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23BQ15437 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23BQ15437 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23BQ15437 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC23BQ15437 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC23BQ15437 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC23BQ15437 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC23BQ15437 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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