Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3A2Q15428 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SF3A2Q15428 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3A2Q15428 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SF3A2Q15428 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms