Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDCD1Q15116 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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