Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 APEX1-206ENST00000553681 899 ntTSL 312.37□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 SF3B3-208ENST00000567250 1084 ntTSL 312.01□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-216ENST00000557159 1803 ntTSL 211.88□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-218ENST00000557344 671 ntTSL 211.47□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-215ENST00000557150 740 ntTSL 311.39□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-209ENST00000555306 898 ntTSL 511.3□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-219ENST00000557365 831 ntTSL 311.3□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-212ENST00000556054 773 ntTSL 311.3□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-220ENST00000557592 640 ntTSL 511.09□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-202ENST00000398030 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-210ENST00000555414 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 APEX1-203ENST00000438886 451 ntTSL 38.24□□□□□ -1.092e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 FAM50A-201ENST00000158526 1240 ntTSL 519.12■□□□□ 0.652e-9■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 MIER1-210ENST00000479067 745 ntTSL 54.98□□□□□ -1.619e-9■■■■□ 20.9
PUM1Q14671 TSPYL2-206ENST00000579390 869 ntTSL 512.93□□□□□ -0.343e-7■■■■□ 20.8
PUM1Q14671 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 20.8
PUM1Q14671 SART1-203ENST00000528573 585 ntTSL 427.46■■□□□ 1.992e-6■■■■□ 20.8
PUM1Q14671 SART1-206ENST00000530251 753 ntTSL 527.46■■□□□ 1.992e-6■■■■□ 20.8
PUM1Q14671 SART1-207ENST00000532333 873 ntTSL 1 (best)25.28■■□□□ 1.642e-6■■■■□ 20.8
PUM1Q14671 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.263e-7■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.523e-7■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.613e-7■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.513e-7■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PPFIA1-222ENST00000532504 5159 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.023e-7■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PPFIA1-206ENST00000526262 4537 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.13e-7■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 MCM4-206ENST00000519138 927 ntTSL 213.18□□□□□ -0.36e-14■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.113e-9■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 214.65□□□□□ -0.063e-9■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.223e-9■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.283e-9■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 213.08□□□□□ -0.323e-9■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.333e-9■■■■□ 20.7
PUM1Q14671 GSE1-209ENST00000479488 649 ntTSL 215.4■□□□□ 0.066e-7■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-244ENST00000485673 715 ntTSL 528.2■■■□□ 2.16e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-243ENST00000484504 662 ntTSL 228.2■■■□□ 2.16e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-235ENST00000478585 543 ntTSL 227.71■■■□□ 2.036e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-228ENST00000469431 702 ntTSL 527.71■■■□□ 2.036e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-257ENST00000604005 693 ntTSL 327.71■■■□□ 2.036e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-224ENST00000464960 986 ntTSL 227.1■■□□□ 1.936e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-226ENST00000467321 733 ntTSL 519.66■□□□□ 0.746e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-250ENST00000491348 1068 ntTSL 319.3■□□□□ 0.686e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-230ENST00000472183 911 ntTSL 319.3■□□□□ 0.686e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-240ENST00000481768 1903 ntTSL 1 (best)18.6■□□□□ 0.576e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-221ENST00000462499 492 ntTSL 216.01■□□□□ 0.156e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-241ENST00000482112 704 ntTSL 316.01■□□□□ 0.156e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-223ENST00000464788 583 ntTSL 215.39■□□□□ 0.056e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.016e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-206ENST00000349036 581 ntTSL 514.56□□□□□ -0.086e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-249ENST00000490374 675 ntTSL 314.56□□□□□ -0.086e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-219ENST00000453292 632 ntTSL 513.26□□□□□ -0.296e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-217ENST00000423897 736 ntTSL 312.65□□□□□ -0.386e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-252ENST00000493744 812 ntTSL 212.65□□□□□ -0.386e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-216ENST00000419558 729 ntTSL 311.36□□□□□ -0.596e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-218ENST00000450130 595 ntTSL 511.13□□□□□ -0.636e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-227ENST00000468895 583 ntTSL 39.59□□□□□ -0.876e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 GNAS-225ENST00000467227 543 ntTSL 37.92□□□□□ -1.146e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 EGFL7-205ENST00000490469 456 ntTSL 517.7■□□□□ 0.428e-8■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 SREBF1-203ENST00000395751 4653 ntTSL 216.23■□□□□ 0.191e-7■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-7■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-7■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 HNRNPM-207ENST00000597081 1004 ntTSL 522.38■■□□□ 1.171e-7■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 HNRNPM-211ENST00000598603 784 ntTSL 219.19■□□□□ 0.661e-7■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.913e-6■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.833e-6■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 TCOF1-210ENST00000506767 869 ntTSL 512.59□□□□□ -0.399e-8■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 BCAT1-207ENST00000543099 568 ntTSL 45.59□□□□□ -1.518e-9■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 20.6
PUM1Q14671 CWC22-202ENST00000410053 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-7■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 CWC22-201ENST00000404136 2392 ntTSL 1 (best)5.51□□□□□ -1.531e-7■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.94e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-215ENST00000439101 779 ntTSL 526.7■■□□□ 1.864e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-209ENST00000424537 781 ntTSL 226.52■■□□□ 1.844e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-210ENST00000426941 575 ntTSL 223.96■■□□□ 1.434e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-219ENST00000452891 575 ntTSL 423.96■■□□□ 1.434e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 221.6■■□□□ 1.054e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-207ENST00000420551 395 ntTSL 521.37■■□□□ 1.014e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 521.01■□□□□ 0.954e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.934e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-214ENST00000436917 499 ntTSL 420.65■□□□□ 0.94e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-227ENST00000483603 572 ntTSL 520.65■□□□□ 0.94e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.664e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.624e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 418.89■□□□□ 0.614e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-232ENST00000495372 561 ntTSL 217.54■□□□□ 0.44e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.384e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.284e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-216ENST00000440109 935 ntTSL 314.94□□□□□ -0.024e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.274e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 312.41□□□□□ -0.424e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 310.95□□□□□ -0.664e-13■■■■□ 20.5
PUM1Q14671 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.01■□□□□ 0.794e-6■■■■□ 20.4
PUM1Q14671 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.464e-6■■■■□ 20.4
PUM1Q14671 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.831e-6■■■■□ 20.4
PUM1Q14671 DNTTIP2-204ENST00000462746 480 ntTSL 26.13□□□□□ -1.431e-6■■■■□ 20.4
PUM1Q14671 SEPT5-208ENST00000431124 920 ntTSL 515.48■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 20.4
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 73.4 ms