Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAMK2DQ13557 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAMK2DQ13557 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAMK2DQ13557 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAMK2DQ13557 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAMK2DQ13557 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAMK2DQ13557 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAMK2DQ13557 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2DQ13557 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAMK2DQ13557 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2DQ13557 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2DQ13557 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2DQ13557 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2DQ13557 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2DQ13557 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2DQ13557 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAMK2DQ13557 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMK2DQ13557 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMK2DQ13557 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAMK2DQ13557 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms