Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTM1Q13496 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTM1Q13496 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTM1Q13496 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MTM1Q13496 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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