Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
XRCC4Q13426 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
XRCC4Q13426 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XRCC4Q13426 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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