Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CBX3Q13185 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBX3Q13185 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBX3Q13185 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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