Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKAA1Q13131 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAA1Q13131 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAA1Q13131 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA1Q13131 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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