Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIK2Q13002 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK2Q13002 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK2Q13002 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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