Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BNIP1Q12981 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNIP1Q12981 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNIP1Q12981 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms