Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 ASN2YGR124W 1719 nt6.53□□□□□ -1.36
NMD4Q12129 AGX1YFL030W 1158 nt6.52□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 TOM20YGR082W 552 nt6.52□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 SPG5YMR191W 1122 nt6.52□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 SMX3YPR182W 261 nt6.52□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 ACO1YLR304C 2337 nt6.51□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 FZF1YGL254W 900 nt6.51□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 ATG23YLR431C 1362 nt6.51□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 YMR034CYMR034C 1305 nt6.5□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 YLL058WYLL058W 1728 nt6.5□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 GAA1YLR088W 1845 nt6.5□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 YCR061WYCR061W 1896 nt6.5□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 ERS1YCR075C 783 nt6.5□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 PPH21YDL134C 1110 nt6.5□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 MRPS28YDR337W 861 nt6.5□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 PRI1YIR008C 1230 nt6.5□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 RPL31BYLR406C 342 nt6.5□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.5□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 ICP55YER078C 1536 nt6.5□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 ATF1YOR377W 1578 nt6.49□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 YHR145CYHR145C 357 nt6.49□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.49□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.49□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.49□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.49□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 LDB7YBL006C 543 nt6.49□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 SLD7YOR060C 774 nt6.49□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 PLB3YOL011W 2061 nt6.49□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 BIO3YNR058W 1443 nt6.49□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 REV7YIL139C 738 nt6.48□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 YJL144WYJL144W 315 nt6.48□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 NUP49YGL172W 1419 nt6.48□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 PAC2YER007W 1557 nt6.48□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 COX15YER141W 1461 nt6.47□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 YBR241CYBR241C 1467 nt6.47□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 MSC3YLR219W 2187 nt6.47□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 HOC1YJR075W 1191 nt6.47□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 ASR1YPR093C 867 nt6.47□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 CYB2YML054C 1776 nt6.46□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 MPH3YJR160C 1809 nt6.46□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 DRS1YLL008W 2259 nt6.46□□□□□ -1.37
NMD4Q12129 YDL177CYDL177C 513 nt6.46□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 CBR1YIL043C 855 nt6.46□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 HBN1YCL026C-B 582 nt6.46□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 RSP5YER125W 2430 nt6.46□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 TAH11YJR046W 1815 nt6.46□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 VTS1YOR359W 1572 nt6.45□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.45□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 LIA1YJR070C 978 nt6.45□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 PUS4YNL292W 1212 nt6.45□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 TMA46YOR091W 1038 nt6.45□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 SKY1YMR216C 2229 nt6.45□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 CYS4YGR155W 1524 nt6.45□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 HED1YDR014W-A 489 nt6.44□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 TRS31YDR472W 852 nt6.44□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 ERG12YMR208W 1332 nt6.44□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 MPA43YNL249C 1629 nt6.43□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 GPD1YDL022W 1176 nt6.43□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.43□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.43□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 SWD1YAR003W 1281 nt6.43□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 YLR122CYLR122C 378 nt6.43□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 AVO2YMR068W 1281 nt6.43□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 SEC62YPL094C 825 nt6.43□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 PAP2YOL115W 1755 nt6.43□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 RSC2YLR357W 2670 nt6.43□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 IES1YFL013C 2079 nt6.42□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 YSC83YHR017W 1158 nt6.42□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 RRN10YBL025W 438 nt6.42□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 ARO7YPR060C 771 nt6.42□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 PPM2YOL141W 2088 nt6.41□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 FMP40YPL222W 2067 nt6.41□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 TOS2YGR221C 1869 nt6.41□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 IME2YJL106W 1938 nt6.41□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 MRPL35YDR322W 1104 nt6.41□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 NTG1YAL015C 1200 nt6.41□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 ATG36YJL185C 882 nt6.41□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 SMK1YPR054W 1167 nt6.41□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 DPB2YPR175W 2070 nt6.41□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 RGD2YFL047W 2145 nt6.41□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 NMD5YJR132W 3147 nt6.41□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 GPH1YPR160W 2709 nt6.41□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 YHR020WYHR020W 2067 nt6.4□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 YFR006WYFR006W 1608 nt6.4□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 CCT3YJL014W 1605 nt6.4□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 RPL2BYIL018W 765 nt6.4□□□□□ -1.38
NMD4Q12129 LAG2YOL025W 1983 nt6.4□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 MKK1YOR231W 1527 nt6.4□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 FCY22YER060W-A 1593 nt6.4□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 EMP65YER140W 1671 nt6.39□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 FET4YMR319C 1659 nt6.39□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 COX16YJL003W 357 nt6.39□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 ECM30YLR436C 3825 nt6.38□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 ADE17YMR120C 1779 nt6.38□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 CLN1YMR199W 1641 nt6.37□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 GCN3YKR026C 918 nt6.37□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 YNR014WYNR014W 639 nt6.37□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 IRC11YOR013W 471 nt6.37□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 PRP2YNR011C 2631 nt6.37□□□□□ -1.39
NMD4Q12129 GSH1YJL101C 2037 nt6.37□□□□□ -1.39
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