Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 YLR312CYLR312C 1197 nt5.9□□□□□ -1.46
ATG41Q12048 CRP1YHR146W 1398 nt5.9□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 CEF1YMR213W 1773 nt5.9□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 COQ1YBR003W 1422 nt5.9□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 ICP55YER078C 1536 nt5.89□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 RPP1YHR062C 882 nt5.89□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 YNL120CYNL120C 486 nt5.89□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 MSC3YLR219W 2187 nt5.89□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 DOT1YDR440W 1749 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 CYS3YAL012W 1185 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 YLR123CYLR123C 330 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 TMA46YOR091W 1038 nt5.88□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 RAP1YNL216W 2484 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 CIS3YJL158C 684 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 PRS4YBL068W 981 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.87□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 IMA5YJL216C 1746 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 NOG2YNR053C 1461 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 YDR306CYDR306C 1437 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 PTH2YBL057C 627 nt5.86□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 TPK1YJL164C 1194 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 DID2YKR035W-A 615 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 YLL056CYLL056C 897 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 RIB1YBL033C 1038 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 TOS2YGR221C 1869 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 TPO3YPR156C 1869 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 GEF1YJR040W 2340 nt5.85□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 KAE1YKR038C 1161 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 KSH1YNL024C-A 219 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 MOD5YOR274W 1287 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 ERG10YPL028W 1197 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 GUT1YHL032C 2130 nt5.84□□□□□ -1.47
ATG41Q12048 BIM1YER016W 1035 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 YLR162WYLR162W 357 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 RFC4YOL094C 972 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 CST26YBR042C 1194 nt5.83□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 NUP49YGL172W 1419 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 VPS61YDR136C 573 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 GPI11YDR302W 660 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 YJR146WYJR146W 354 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 SWD1YAR003W 1281 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 DUS4YLR405W 1104 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 YNL092WYNL092W 1203 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 MRPL19YNL185C 477 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 YOR343CYOR343C 327 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 YEL023CYEL023C 2049 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 RIO1YOR119C 1455 nt5.82□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 TKL2YBR117C 2046 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 STF1YDL130W-A 261 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 AIM24YJR080C 1185 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 OGG1YML060W 1131 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 RKI1YOR095C 777 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 HSM3YBR272C 1443 nt5.81□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 COQ3YOL096C 939 nt5.8□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 PFK2YMR205C 2880 nt5.8□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 COX10YPL172C 1389 nt5.8□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 PGM1YKL127W 1713 nt5.79□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 PPM1YDR435C 987 nt5.79□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 HEL1YKR017C 1656 nt5.79□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 DMA1YHR115C 1251 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 YML6YML025C 861 nt5.78□□□□□ -1.48
ATG41Q12048 BSC4YNL269W 396 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 FIT2YOR382W 462 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 YPL257WYPL257W 582 nt5.77□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 YKL077WYKL077W 1179 nt5.76□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 MRPL23YOR150W 492 nt5.76□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 YJL163CYJL163C 1668 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 PEX3YDR329C 1326 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 COA1YIL157C 594 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 YML079WYML079W 606 nt5.75□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 CSC1YLR241W 2349 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 RGD1YBR260C 2001 nt5.74□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 MFG1YDL233W 1377 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 STB5YHR178W 2232 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 COX9YDL067C 180 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 QCR8YJL166W 285 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 ICT1YLR099C 1185 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 HXT2YMR011W 1626 nt5.73□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 FAL1YDR021W 1200 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 MRPL1YDR116C 858 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 YIR042CYIR042C 711 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 IES2YNL215W 963 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 YIL055CYIL055C 1884 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 SKI2YLR398C 3864 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 PUS7YOR243C 2031 nt5.72□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 YDR514CYDR514C 1452 nt5.71□□□□□ -1.49
ATG41Q12048 YDR278CYDR278C 318 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 AGX1YFL030W 1158 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 MDE1YJR024C 735 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 LDB16YCL005W 771 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YGR054WYGR054W 1929 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 FET4YMR319C 1659 nt5.71□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 HRQ1YDR291W 3234 nt5.7□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YKL102CYKL102C 306 nt5.7□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 ARA2YMR041C 1008 nt5.7□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YPR076WYPR076W 375 nt5.7□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YHK8YHR048W 1545 nt5.69□□□□□ -1.5
ATG41Q12048 YHL017WYHL017W 1599 nt5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1478.8 ms