Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NIPAL4Q0D2K0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NIPAL4Q0D2K0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NIPAL4Q0D2K0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NIPAL4Q0D2K0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms