Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFFO1Q0D2I5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFFO1Q0D2I5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms