Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD300CQ08708 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD300CQ08708 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD300CQ08708 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD300CQ08708 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD300CQ08708 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD300CQ08708 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD300CQ08708 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CD300CQ08708 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD300CQ08708 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD300CQ08708 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD300CQ08708 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD300CQ08708 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD300CQ08708 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CD300CQ08708 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD300CQ08708 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms