Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF4Q08170 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF4Q08170 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215 ms